El Directorio es el órgano rector del CLIPP y sus principales funciones son planificación estratégica, deliberación y toma de decisiones. En él confluyen representantes de la Universidad de Chile, del sector público, de la sociedad civil y del sector empresarial, junto con el equipo ejecutivo del Co-laboratorio. Este directorio define el Plan Estratégico, supervisa su cumplimiento, aprueba el presupuesto y determina la continuidad o rediseño de las líneas de innovación. Su composición refleja la pluralidad del ecosistema que busca movilizar: academia, Estado, empresas y sociedad civil deliberan en un mismo espacio, garantizando diversidad de perspectivas y legitimidad en las orientaciones estratégicas.
El Equipo Ejecutivo del CLIPP coordina la gestión estratégica y operativa del Co-laboratorio, asegurando la coherencia entre las líneas de innovación, las acciones de transferencia y los programas de formación. Está conformado por profesionales que trabajan de manera integrada para traducir evidencia científica en soluciones con propósito público. Su labor combina la planificación, la facilitación de procesos colaborativos y el seguimiento de los proyectos, garantizando articulación permanente con el Directorio, el Consejo Asesor y las instituciones asociadas.
El ecosistema de socios del CLIPP reúne universidades, centros de investigación, organismos públicos, empresas y organizaciones de la sociedad civil comprometidas con la creación de innovaciones con propósito público. Estas alianzas fortalecen la dimensión policéntrica del CLIPP, integrando capacidades diversas para desarrollar proyectos conjuntos, compartir evidencia y escalar soluciones. Cada socio aporta su experiencia y contexto, conformando una red abierta y colaborativa que amplía el alcance y la sostenibilidad de las iniciativas del Co-laboratorio.